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enLbCas12a Nuclease

貨號 32135 售價(元) 詢價
規格 100pmoL/1000pmoL CAS號
  • 產品簡介
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產品簡介

enLbCas12a(enhanced LbCas12a)是一種基于野生型LbCas12a核酸內切酶升級改造獲得的高活力LbCas12a突變體。與野生型LbCas12a的作用機制一樣,enLbCas12a也通過crRNA介導,靶向識別帶有PAM序列(5’-TTN-3’)的雙鏈DNA,使DNA雙鏈斷裂并產生粘性末端。同時,enLbCas12a對單鏈DNA靶標的識別和剪切不依賴PAM序列。雙鏈或單鏈DNA靶標均能激活enLbCas12a的反式剪切活性(即旁路剪切活性/附屬剪切活性),即當enLbCas12a酶與crRNA、靶標DNA結合形成三元復合物后,便會被激活針對非特異ssDNA序列的反式剪切活性,將體系中的ssDNA序列切碎。因此,enLbCas12a酶不僅可用于體外dsDNA的特異剪切,也可用于靶標核酸的快速檢測。

 

產品組分

組分 32135-01 (100 pmol) 32135-03 (1,000 pmol)
enLbCas12a Nuclease (10 μM) a 100 pmol 1,000 pmol
10×HOLMES Buffer for Cas12a 1 mL 1 mL

a. enLbCas12a Nuclease濃度為10 μM,即10 pmol/μL;100 pmol規格的總體積為10 μL,1,000 pmol規格的總體積為100 μL;

 

保存條件

-80℃或-20℃儲存;干冰運輸。

 

活性定義

在總體積為20 μL的1 × HOLMES Buffer for Cas12a [pH 8.5]反應體系中,37℃反應條件下,1 min內剪切1 pmol ssDNA探針所需的Cas12a酶量定義為1 transU。

例:若某批次enLbCas12a酶的反式切割活性為80.0 transU/pmol,則表明1 pmol的該批次enLbCas12a酶可在1 min內,在上述指定的反應條件下,反式切割80 pmol ssDNA探針。

 

實驗流程

1. 順式剪切實驗

組分 體積 終濃度
10×HOLMES Buffer for Cas12a 2 μL 1 ×
10 μM enLbCas12a Nuclease 0.5 μL 250 nM
10 μM crRNA 0.5 μL 250 nM
1 μM Target DNA b 0.5 μL 25 nM
Nuclease-free Water Up to 20 μL  

b. 順式剪切體系中Target DNA可為ssDNA或帶PAM序列的dsDNA。

若用核酸電泳來分析順式剪切產物,建議使用dsDNA靶標,因為ssDNA靶標會被反式激活的Cas12a進一步切碎。對于20 μL順式剪切應體系,推薦target DNA的使用量為100 ng~500 ng,且target DNA片段長度在300 bp~3 kb范圍內。不同長度target DNA需要的Cas酶和crRNA的量需要根據target DNA的摩爾量計算,建議保持Cas酶:crRNA:target DNA的摩爾比為10:10:1,以盡量確保target DNA被剪切完全。

37℃反應30 min ~ 1 h,85℃滅活5 min,核酸電泳分析順式剪切產物。

 

2. 反式剪切實驗

組分 體積 終濃度
10×HOLMES Buffer for Cas12a 2 μL 1 ×
10 μM enLbCas12a Nuclease  0.05~0.5 μL 25~250 nM
10 μM crRNA 0.05~0.5 μL 25~250 nM
1 μM Target DNA c 0.5~5 μL 25~250 nM
10 μM ssDNA Reporter 0.05~0.5 μL 25~250 nM
Nuclease-free Water Up to 20 μL  

c. 反式剪切體系中Target DNA可為ssDNA或帶PAM序列的dsDNA。

反式剪切體系中各組分的用量可以根據不同的實驗目的進行調整,用量較少時可先將各組分稀釋后加入體系,enLbCas12a Nuclease可用1×HOLMES Buffer for Cas12a稀釋,稀釋后需立即使用(若要稀釋后的Cas12酶長期保存,請使用Cas12 Dilution Buffer,#32012),crRNA、Target DNA及ssDNA Reporter可用Nuclease-free Water稀釋,但極低濃度的Target DNA(例如LOD實驗)建議用0.1% Tween 20稀釋并使用低吸附的離心管、吸頭等耗材。

實時熒光定量PCR儀檢測熒光信號,37℃反應,每30 sec采集一次熒光信號。

 

實驗結果

順式剪切

反式剪切

 

注意事項


1. 高活力的enLbCas12a酶crRNA的DR序列(Direct Repeat)與野生型LbCas12a(#32108)一致,可以在反應體系中用enLbCas12a酶直接替換野生型LbCas12a。
2. 不同來源的Cas12a酶,其識別靶標所需的PAM位點也略有不同,其中大部分Cas12a酶可識別TTN或TTTN位點。
3. Cas12a的順式剪切(cis-cleavage):Cas12a在crRNA的引導下,特異性地剪切target DNA。dsDNA靶標需帶有PAM位點,而ssDNA靶標不依賴PAM位點。
4. Cas12a的反式剪切(trans-cleavage):當target DNA存在時,Cas12a/crRNA與target DNA形成三元復合物(Cas12a/crRNA/target DNA),同時,Cas12a被激發反式剪切活性,將反應體系中任意序列的單鏈DNA切碎。
5. 利用本產品的反式剪切活性進行分子診斷實驗,可參考本公司的HOLMES體系[1]。
6. 為防止RNase污染,請保持實驗區干凈整潔,操作時需穿戴干凈的手套、口罩,實驗所用槍頭、離心管等耗材均為RNase-free。
7. Cas12a酶對熱敏感,容易失活,應全程冰上配置反應體系,并在使用后立即將酶置于-20℃保存。
8. 本產品僅供科研使用。